廈門(mén)市博物館于1983年籌建，1988年正式對(duì)外開(kāi)放，舊館原址位于舉世聞名的風(fēng)景名勝區(qū)——鼓浪嶼上的八卦樓。隨著廈門(mén)經(jīng)濟(jì)和各項(xiàng)事業(yè)的快速發(fā)展，作為洋樓民居的八卦樓無(wú)論在建筑的規(guī)模，還是在結(jié)構(gòu)和功能等方面都不能滿(mǎn)足博物館保護(hù)、展示文化遺產(chǎn)以及事業(yè)發(fā)展的需要，2004～2006年廈門(mén)市政府利用廈門(mén)工程機(jī)械廠(chǎng)舊廠(chǎng)房，改建為廈門(mén)市文化藝術(shù)中心。廈門(mén)市博物館的新館就位于它的東北部，建筑面積25300平方米，展廳面積9597平方米，庫(kù)房面積2800平方米。新館較之舊館，建筑面積擴(kuò)大6倍。2006年6月，經(jīng)中共廈門(mén)市委機(jī)構(gòu)編制委員會(huì)批準(zhǔn)，將廈門(mén)市鄭成功紀(jì)念館、廈門(mén)市文化遺產(chǎn)保護(hù)中心并入廈門(mén)市博物館，如今的廈門(mén)市博物館由廈門(mén)博物館主館、鄭成功紀(jì)念館、廈門(mén)經(jīng)濟(jì)特區(qū)紀(jì)念館、廈門(mén)市文化遺產(chǎn)保護(hù)中心、思明破獄斗爭(zhēng)陳列館、陳化成紀(jì)念館、陳勝元故居七個(gè)部分組成。為全民所有制事業(yè)單位，隸屬?gòu)B門(mén)市文化局管理，核定人員編制64人，目前有博士學(xué)歷的1人，碩士學(xué)歷的5人，研究館員9人，副研究館員6人。現(xiàn)任館長(zhǎng)兼書(shū)記張仲淳、副館長(zhǎng)曾瑩、靳維柏（兼廈門(mén)文保中心主任）。
　　廈門(mén)市博物館現(xiàn)有“廈門(mén)歷史陳列”、“閩臺(tái)古石雕大觀(guān)園”、“閩臺(tái)民俗陳列”等基本陳列展對(duì)外開(kāi)放，其中后者的前身——舊館的“閩臺(tái)民俗展”曾榮獲1998年全國(guó)文物陳列十大精品獎(jiǎng)。 此外“中國(guó)民族民間樂(lè)器陳列”、“館藏文物精品陳列”兩個(gè)基本陳列也在緊張的籌備和布展中。常年對(duì)外開(kāi)放的基本展覽還有鄭成功紀(jì)念館的“鄭成功史跡陳列”、廈門(mén)經(jīng)濟(jì)特區(qū)紀(jì)念館的“輝煌歲月——廈門(mén)經(jīng)濟(jì)特區(qū)建設(shè)歷史陳列”、廈門(mén)破獄斗爭(zhēng)舊址的“廈門(mén)破獄斗爭(zhēng)陳列”、陳公祠的“陳化成事跡展”、 陳勝元故居的“鴉片戰(zhàn)爭(zhēng)與廈門(mén)”歷史展。
 
　　廈門(mén)市博物館注重加強(qiáng)館際交流，不定期舉辦各種臨時(shí)展覽活動(dòng)。建館以來(lái)舉辦的臨時(shí)展覽主要有：廈門(mén)特區(qū)建設(shè)展、友好往來(lái)展、館藏玉器展、廈門(mén)書(shū)畫(huà)精品展、廈門(mén)體育明星展、鼓浪嶼建筑攝影圖片展、閩南民間古陶瓷展……廈門(mén)海堤建設(shè)歷史陳列、文物科技保護(hù)圖片展、閩臺(tái)姓氏族譜和涉臺(tái)文物展、走近大師——?jiǎng)⒑Ｋ谧髌氛埂ⅰ凹t色記憶”收藏品特展、頂級(jí)生活藝術(shù)品展 、慶祝中華人民共和國(guó)成立60周年——福建文博成就展、“三八”國(guó)際勞動(dòng)?jì)D女節(jié)100周年暨女職工周末學(xué)校成果展、 書(shū)·香·茶·花---兩岸文物精品展 、第二屆世界投資論壇文物精品展、第三次全國(guó)文物普查成果圖片展、梁連泉收藏書(shū)畫(huà)展、北京故宮藏金銀器展、玉石文化博覽會(huì)、歷代國(guó)寶級(jí)書(shū)畫(huà)高仿真精品大展、 “八閩豐碑”全省革命歷史文物聯(lián)展、東風(fēng)西漸——上海歷史博物館館藏歐洲瓷器展、石刻史書(shū)——寧夏巖畫(huà)展、廈門(mén)市古代藝術(shù)品研究會(huì)會(huì)員藏品展等數(shù)十個(gè)展覽。此外廈門(mén)特區(qū)紀(jì)念館還舉辦過(guò)“廈門(mén)市重點(diǎn)建設(shè)成就展”、和“鷺江號(hào)游艇歷史陳列”等臨時(shí)展，該館工作人員還參加和負(fù)責(zé)過(guò)《廈門(mén)經(jīng)濟(jì)特區(qū)三十周年成就展》的展覽工作。
 
　　廈門(mén)市博物館現(xiàn)有館藏文物近20000件，已經(jīng)鑒定的三級(jí)以上文物共3983件，其中以古代的陶瓷、書(shū)畫(huà)、玉器、石雕和民俗文物以及國(guó)際友誼禮品等為主并最有特色。